樟芝擁有許多優異的生理活性成分，其中以紅樟芝由於含有高量且多種類的三萜類化合物（triterpenoids）為牛樟芝中的極品，因三萜類表現為紅色故而稱紅樟芝，功能會因三萜類結構及種類而有所差異，也就是不單以含量多寡為主要評估樟芝品質及功效的優劣。

根據現代科學實證精神，樟芝品質及功效主要會因菌種的良莠、栽培方式、培養基的設計、環控條件、加工萃取等而有非常顯著的差異，因此在判斷樟芝的良莠須以該原料所做之各項安全性、功能性之細胞實驗、動物實驗及人體實際使用經驗做綜合判斷的準則。